Чем дольше возделывается земля на приусадебном участке, тем больше она окультуривается. Благодаря ежегодному внесению органики в пахотном горизонте накапливаются гуминовые вещества. Постоянные обработки способствуют улучшению структуры почвы, она становится мелкокомковатой, рыхлой, повышается её влагоудерживающая способность, улучшается макро- и микробиологический состав. Верхний слой, практически постоянно поддерживаемый в увлажнённом состоянии, густо заселяется микроскопическими клещами, утилизирующими грубые растительные остатки; весь плодородный слой обживается дождевыми червями, улучшающими его аэрацию.

Совсем другие процессы наблюдаются в защищённом грунте. Здесь земля используется намного более интенсивно. Так как плотность размещения растений в теплице высокая, междурядные обработки практически никогда не производятся. Почва быстро уплотняется. Так как в защищённом грунте нормы внесения минеральных удобрений повышенные, земля быстро закисляется, потому что питательная часть вносимых солей, имеющая щелочную реакцию, усваивается растениями, а кислотный остаток остаётся в почвенном растворе. Одновременно земля засоляется, так как удобрений вносится много и часть из них растения по ряду причин не успевают усвоить. Из-за интенсивного использования тепличные почвы быстро теряют продуктивные запасы гумусных кислот.

Помимо всего прочего в теплицах более благоприятные условия развития для болезнетворных микроорганизмов. Поэтому мероприятий по защите растений здесь приходится проводить больше. Тем не менее заселённость теплиц и парников патогенами всегда выше, чем в открытом грунте. А количество остаточных химикатов в почве велико.

В связи со всем вышесказанным, питательный субстрат в защищённом грунте необходимо достаточно часто менять. Осенью в теплицах после того, как будут удалены все растительные остатки, проводят частичную замену грунта.  Верхний слой почвы в сооружениях защищённого грунта всегда содержит много спор вредоносных грибков и бактерий. Кроме того, в нём могут зимовать тепличные клещи, а также самки тепличной белокрылки. Поэтому здесь необходимо менять ежегодно как минимум 5 см верхней земли. Эту почву снимают совковыми лопатами и вывозят в сад.

Помимо этого, не реже чем раз в 5 лет следует полностью заменять субстрат на свежий. Сначала убирают все растительные остатки. Из-за высокой засорённости патогенами компостировать их нельзя. Только сжигать. После этого весь грунт на глубину 30 см вывозят и закладывают в бурт. Через 2 года его можно раскидать в огороде.

Следующий этап – обеззараживание. Все конструкции и внутренние поверхности в теплице промывают мыльным раствором, а затем обрабатывают фунгицидным препаратом. Подстилающий слой земли также обеззараживают, поливая его 1%-ным раствором бордоской смеси. После этого завозят новую землю. Она должна быть смешана с большим количеством зрелого компоста и верхового торфа, который предварительно раскисляют садовой известью. Кроме того, если теплица ежегодно занимается преимущественно сладким перцем и томатами, в землю рекомендуется добавить порядка 5% перлита. Если теплица занимается преимущественно огурцом, необходимо завозить больше зрелого компоста.